曼尼托巴大学的优势专业多种多样，主要有法律、工程技术、建筑、教育、理科学、旅游、农林类、人文艺术、社科类、生物、体育、新闻传播、信息科学、金融与经济、建筑、化学工程、经济、教育、电子工程、计算机科学，考古学、生物化学、人类学与地理、神学、美术、现代史、自然科学、心理研究等。
曼尼托巴大学开设专业
文学类
经济学、心理学、社会学、文学、电影、戏剧、地理，历史，语言学，哲学、亚洲研究、中东欧研究、妇女研究、土著人研究、宗教及英、法、西、德、意等语言研究
理学类
数学、物理、化学、生物学、植物学、生态学、环境科学、遗传学、地质科学、微生物、物理及天文学、统计学、动物学、生态系统工程学，农业科学，建筑，民用及地质工程
计算机类
计算机工程，计算机科学
医学类
麻醉学，生化医药、遗传学，临床心理学，医药史，解剖学和细胞学，免疫学，微生物学，妇产科学，眼科学，病理学，药理学，外科学
建筑类
室内设计、环境设计
工程类
生物工程、计算机工程、电子工程、机械工程、土木工程、生物医学工程
人类生态类
食品与营养学、家庭研究、服装与纺织系、信息管理系统、企业管理、行政管理、市场营销
农业及食品科学类
农艺学、动物/植物学、农业经济学、食品营养学
另有护理、文体娱乐、医药、牙科、教育、艺术、音乐等专业。学校提供广泛的文学士理学士商学士硕士博士课程，其中以农业学、工学、医学著名。杰出专业有计算机科学、英语、历史学、管理和心理学。
曼尼托巴大学校内学院
曼尼托巴大学的22个系总共录取了大约30000名学生（研究生：18%，远程学生：3.5%，本科生：78.5%）。多数学科有硕士部门和博士部门。
附属学院
圣玻尼费斯大学
工程学院
圣约翰学院
圣保罗学院
圣安德鲁学院
农业与食品科学系
农业系
建筑系
艺术学院
文学院
Clayton H. Riddell 环境、地质与能源系
牙科系
牙齿卫生学院
教育系
工程系（方向：生物工程、土木工程、计算机 工程、电子工程、生物医学工程和机械工程）
扩展教育
人类生态系
I. H. Asper商学院
法律系
Marcel A. Desautels音乐系
医疗复原系
医学系
护理系
药剂系
运动与再生管理系
理学院，包括计算机科学系。
社会工作系
远程教育部门
U1（学生可以推迟到第二年入系）
